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Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  33 lines
  1. **********************************
  2. * Signal peptidases II signature *
  3. **********************************
  4.  
  5. Signal peptidases (SPases) [1]  (also  known  as leader peptidases) remove the
  6. signal peptides from secretory proteins.  In prokaryotes three types of SPases
  7. are known: type I (gene lepB) which is responsible for  the  processing of the
  8. majority  of  exported pre-proteins;  type II (gene lsp)  which  only  process
  9. lipoproteins, and a third type involved in the processing of pili subunits.
  10.  
  11. SPase II   (EC 3.4.99.35),   also   known  as  lipoprotein  signal  peptidase,
  12. recognizes a  conserved  sequence  and  cuts in front of a cysteine residue to
  13. which a  glyceride-fatty  acid  lipid  is  attached.  SPase  II is an integral
  14. membrane protein that is anchored in the cytoplasmic membrane.
  15.  
  16. There are  a  number  of  conserved  regions  in the sequence of Spase II from
  17. various bacteria  [2],  we  have  selected one of these regions as a signature
  18. pattern.
  19.  
  20. -Consensus pattern: G-A-L-G-N-[LIVMFY](2)-D-R
  21. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  22. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  23.  
  24. -Expert(s) to contact by email: von Heijne G.
  25.                                 gvh@csb.ki.se
  26.  
  27. -Last update: October 1993 / First entry.
  28.  
  29. [ 1] Dalbey R.E., von Heijne G.
  30.      Trends Biochem. Sci. 17:474-478(1992).
  31. [ 2] Zhao X.J., Wu H.C.
  32.      FEBS Lett. 299:80-84(1992).
  33.